虽有合法手续，亦有正当理由，但未经主人同意而强行进入他人住宅，是否合法

这样的情况要分两种：
一、以单位形式存在的执法机关持合法的身份证明与入宅手续，这样是合法的
二、如果是以个人的身份进入那就是非法的了，试想，如果每个人都有自己的正当理由进入他人住宅，那天下不是乱了套了。