Important as his discovery was, it was regarded as a matter of no account in his time.

不能那样改变句子顺序，前半句是是讲条件的，把important放在句首意在突出其重要性，可改作Though his discovery was important,

可能翻译成即便吧，即便他的这个发现很重要，但是在他的一生中还是被认为是不值得一提的小事情。

这里是倒装，as/though引导的状语从句形容词位于句首的倒装。翻译为：尽管他的发现很重要，但在他那个年代根本没被认为是件重要的事。