我的三方协议现在公司已盖好章，但我拿到学校，却说要人才先盖学校在盖，但是人才却说学校先盖？

这个你最好去问你们班的辅导员。我签的时候是公司先盖章后，然后直接找辅导员，然后自己网上登记，辅导员网上鉴定，鉴定后辅导员会开一个证明让你去学校的就业指导中心盖章，学校拿到学校那联，然后把单位联返给公司。
你现在不要急，打电话问问辅导员，或是你们班其他已经签协议的人。