电脑软件是怎么实现对硬件的控制的?

你的操作调用shell功能
shell函数调用系统api函数
api函数控制调用BIOS
BIOS负责基本的硬件控制.

shell-外壳功能
api-应用程序接口
BIOS-硬件基本输入输出

有点难度，请楼下回答～！

这涉及到电子电路控制学的问题了 建议去看看相关资料

你的标题很难概括回答,但单就管机来讲是:
主板上有电源控制集成电路,控制电脑主机里每一个部件的电压和流量,现在的ATX结构开关机是由一个橙色线，PG(Power Good)信号，高电平(4.7V)以上有效.和绿色线，电源软开关,即PS-ON(Soft On/Off).
其实ATX结构关机并不是真正关闭了电源而是进入了"深层待机"状态,当绿色线接到个(是高于还是低于忘了)电压变换信好时即开机,相反即关机.

建议楼主先好好学习微机原理，这们课程在大学本科（电子类）大二或者大三开设，你对处理器，系统总线，I/O端口等熟悉以后，别人才能和你说明白，当然这个难度很大