不同动物间染色体的数目为什么会不同？多了好还是少了好？不是同一个祖先吗？

没有多好还是少好一说，
虽然来自同一祖先，假定这个统一祖先被某种天然屏障分隔在不同地方不同环境下。最先是形成两个亚种，最后可以形成不同生物，此时这两个生物的基因组成已有区别，这时候又由于某种原因这个天然屏障消失了，两种生物又在及其偶然的情况下中间杂交（像骡子或狮虎兽），又及其偶然发生了染色体加倍，于是又一个崭新的物种产生了。

染色体是由DNA和结合蛋白组成的，DNA是遗传物质，生物在进化过程中，遗传物质会发生突变，经过千万年的突变变异，才形成了丰富多彩的生物世界。动物进化越高等，DNA就越复杂，但是染色体数目不一定多，决定遗传物质的还和染色体长度有 关，因此并不能轻易说染色体数目多好还是少了好。
生物是不断进化的，如果是同一个祖先，都不变异，染色体一样，基因组也一样，永远不变，那这个世界就只有最原始的那一种生物了，就没有丰富多彩的生物世界了。
你的问题是个大问题，想了解更多的话可以看看分子生物学书等

多了少了都不行，但按理来说，染色体的数目越多生物就越高级