过去门派

这件事就相当复杂了，按金庸的《倚天屠龙记》来说，张君宝（张三丰）原在少林寺和他的师父觉远大师共同打理藏经阁，觉远在打理藏经阁时，无意中学了达摩祖师的九阳神功，于是遭到众僧人的追杀。无奈之下觉远带着张君宝反出少林。在途中遇到正在寻访杨过的郭襄，郭襄看着众僧人追杀张君宝师徒，于是拔刀相助，无奈不是众僧对手。觉远大师凭着九阳神功的内力带着君宝和郭襄逃走了，后来觉远大师在临终前把九阳神功传给了张君宝和郭襄，张君宝后来领悟神功终于在武当山创立武当派也而张君宝也就是后来的张三丰。而郭襄在40岁时也看破红尘，凭着九阳神功创立峨嵋派。所以武当源于少林。

江湖上的事

根据小说上来讲呢，少林之中分化武当 然而郭襄创建峨嵋，郭襄又和武当的创始人张三丰关系莫逆，所以武当和峨嵋关系很好，和少林关系不怎么样