如对方企业要做一笔广告,投入300万到我公司,但经办人要回扣100万元,是否可按劳务费支付给他?

不可以，这样的回扣是非法的，不能据实反映。如果非要以劳务费列支，也要换个名目，并应提供劳务用工协议、支付劳务报酬清单、劳务人员身份证明、经办人员身份证明、税务登记证副本等资料，开具劳务发票。