老版本《标准日本语》「头痛がして、食欲がありませんでした。」我不明白头痛后面为什么不用Wo，而用Ga？

因为这是固定用法，你可以联想到（…気がする）这一用法，表示“感到……；觉得……”，其实对于你的这两种选择是很容易分辨的，建议你再好好了解下を的用法，像は和が有时候可以互换，但を不可以，有を存在的情况一般都有动作发生，多看点书，这个问题是很容易明白的，加油！

が和は都是助词..用法不同..
很麻烦..自己慢慢学习吧...