个体营业执照没办这样工商罚我合法吗？

合法。

《无照经营查处取缔办法》第十四条：对于无照经营行为，由工商行政管理部门依法予以取缔，没收违法所得；触犯刑律的，依照刑法关于非法经营罪、重大责任事故罪、重大劳动安全事故罪、危险物品肇事罪或者其他罪的规定，依法追究刑事责任；尚不够刑事处罚的，并处2万元以下的罚款；无照经营行为规模较大、社会危害严重的，并处2万元以上20万元以下的罚款；无照经营行为危害人体健康、存在重大安全隐患、威胁公共安全、破坏环境资源的，没收专门用于从事无照经营的工具、设备、原材料、产品(商品)等财物，并处5万元以上50万元以下的罚款。

你无照经营长达三年了，才罚你三千，算是少了。只能说，你的法律意识实在太淡薄。既然是想做稳定生意的，就老老实实办证吧。

没办证属于无证经营，要罚款。你可以找一些关系，少罚一些。

人家是政府

合法的.