有些植物细胞在显微镜下可以看到绿色颗粒，有些没有，为什么会出现这种情况，最根本的愿因是什么

个人认为是这样：
绿色的颗粒是叶绿体，但是并不是所有植物细胞都具有叶绿体。只有同化组织的细胞才具有叶绿体，比如叶片中的栅栏组织和海绵组织；而其他细胞则没有叶绿体，比如叶脉中的导管和筛管。这是造成有些能看见叶绿体有些不能看见叶绿体的原因。
切片不匀只是技术问题。

这跟显微镜的调节情况以及切片的厚度有关。
就是说，显微镜的焦距、光线这些因素会影响所看到的情况，如果切片厚了，光线无法通过，那也会看不清楚的。