分子轨道形成时,处于振幅为正的电子和振幅为负的电子运动状态有什么不同?

问题问得有点使人发蒙。慢慢才猜出你的意思。
首先应该不是振幅，应该是电子的自旋状态。当电子没有成对的时候电子的自旋状态可以为正也可以为负。具体是为正还是为负是不知道的。只是知道在同一能级的不同轨道的单电子的自旋方向相同（同时为正或者同时为负），电子成对后我们知道这两个成为一对的电子自旋方向相反。
当电子成对后能量会降低，这样电子出现的概率就向低能级变化。

电子运动服从波函数的规律，出现概率与波函数振幅平方成正比。
处于振幅为正的电子和振幅为负的电子运动状态有什么不同不清楚，但当两原子相遇后波函数发生了叠加产生新的波函数，即分子轨道，电子按叠加后的波函数运动，出现概率就变了，具体说就是在两原子之间的概率变大。
而且分子轨道形成是满足对称性匹配的，符号相反的原子轨道不能叠加。