自治旗和自治县不是一个级别，请问他们名字不一样，是否有什么本质的区别？？

是同一个级别,都是依据少数民族自治条例设置的县级行政区域.称呼不同而已。

自治旗是内蒙古自治区独有的,现在就有一个莫力达瓦达斡尔族自治旗,以斡尔族居民为主的自治旗.

在其他省、自治区、直辖市，县级的少数民族自治区域都叫自治县。

是一个级别，只是因为那是因为自治旗是内蒙古民族自治区的划分，内蒙古的地方很多都是叫旗的····