有么有办法让设置好的多核CPU与程序的关系设置每次开机都不变？

可以使用WinLauncherXP
双核处理器确实在硬件上提高了处理速度，但需要系统把运算工作合理地分配给每个核，才能真正发挥双核处理器的性能。从“任务管理器”中选择某个进程，右击打开“处理器关系”对话框，可以在这里设置进程对应的核心，但重启后设置会自动失效。可以把这个任务交给软件来完成。

WinLauncherXP可以非常方便地安排各个程序所使用的处理器核心，甚至还可以设置处理器的优先级别，既免去了重启后失效的麻烦，又能充分发挥双核的强大功能（下载地址：http://www.ocxtreme.org/coolaler/winlauncherxp.rar）。