exe文件都被感染并删除了，这样的系统能正常运行吗？囧。

建议重安系统。。。。。

你真的以为这样就万事大吉了？
删除并不是最好的解决办法！
你应该做的是清除病毒，
而不是删除染毒文件。
就像人生病，
不能把感染的组织全部杀死，
应该清除病毒。
建议用一些有针对性的软件进行查杀（金山毒霸不错，不过推荐用卡巴斯基）。
记得要在安全模式下进行。
杀完后用360安全卫士进行扫描。
给系统打好补丁，
就OK了。
附带提一句，如果安全模式不能进了，
可以去下载安全模式修复工具。
如果还是不行，
有没有什么重要文件在电脑里的话，
建议你全盘格式化。
只能帮你那么多了。
祝你好运！

如果你现在的系统无法操作或是无法正常启动关闭则说明你的系统已经损坏了，你感染的可能是蠕虫病毒，这种病毒很烦人的，建议你将图片、音乐、影视等未被感染的文件先考出来然后将整个硬盘格式化，然后再重新安装系统，系统安装完了之后用杀毒软件进行一下全盘扫描。这样最起码保险一些。

一般清除病毒功能是不删除文件的，但是删除感染文件不同，要是删的就不知道会发生什么了，只清除病毒不会出现问题，不管删除的文件是什么后缀名

应该能,但建议你将你的电脑完全杀毒,,,或者从装系统,那样会更好!!免的那天你家电脑边黑频了!!!!