加班费的计算,奖金,津贴,补助,基本工资都含在基数里吗?

不一定，比如午餐补助，出差补助，怎么可能算在基数里面，年终奖金肯定也不能算的。每月的奖金是否算要看具体情况，如果是每月固定的，就相当于工资一样，可能就算。如果是领导随意奖的，那么就不能算。
总之要看具体情况。

应该按每月正常工资的平均数。在正常的工资中包含什么就有什么。这要看你的工资合同。
对于行政事业单位来说，按习惯或按单位规定算。