为什么我的电脑在安全模式里有应用软件

那是快捷图标，没有加载。
按Ctrl+Alt+Del组合键打开的“任务管理器”第二页里面才是加载的软件（Win98直接出现加载列表）。

那是快捷方式，并没有加载，加载是指程序运行。

安全模式是说除了系统必须的，没有其他的运行程序，桌面上的是快捷方式，不属于运行的

安全模式是Windows操作系统中的一种特殊模式，经常使用电脑的朋友肯定不会感到陌生，在安全模式下用户可以轻松地修复系统的一些错误，起到事半功倍的效果。安全模式的工作原理是在不加载第三方设备驱动程序的情况下启动电脑，使电脑运行在系统最小模式，这样用户就可以方便地检测与修复计算机系统的错误。而只要在启动计算机时，在系统进入Windows启动画面前，按下F8键(或者在启动计算机时按住Ctrl键)，就会出现操作系统多模式启动菜单，只需要选择“Safe Mode”，就可以将计算机启动到安全模式。
安全模式里，很多程序和进程开机时，是不被调用的，
另，为什么说杀毒进安全模式比较好呢？
因为假如病毒感染了开机运行，且不能终止进程（不能被关闭）的程序或者文件后，杀毒软件在正常（非安全模式下）是不容易清除病毒的，因为文件正在使用中，在安全模式下，有些文件开机不被调用就没了这个情况。
这也就是为什么说在DOS下杀，比安全模式还要可靠。微软的视窗系统几乎都有安全模式的