快速关机和重新启动是否会很占用CPU使用率？

不会，到“任务管理器”的“进程”标签下看看。

是什么进程占用了40% 的CPU使用率。

没有关系。
开启自动启动程序太多。
用360 看下，没必要的都关掉

你的所谓其他程序都不开，应该是指你自己没有动手开，有可能是开机就自动运行了什么程序，当然也就有可能是病毒程序。你现在可以在开始运行里输入msconfig,然后点击启动，只留一个CTFMON这个项目，其他的都不启动，然后重新启动再看看

你打开任务管理器看看是哪个程序占了你那么高得CPU使用率，看看能关吗？不能关得话杀下毒试试，还不行就重装系统吧