是不是基因叫什么名字 它转录翻译的蛋白也叫什么名字

这好像不是充分必要条件关系。
基因——×→蛋白 蛋白——→基因

在文献上一般是这样的。即基因名称（一般为小写，斜体）对应蛋白名称（一般为大写，正体）。

基本上是这样的，如：Bt基因指导合成的蛋白就是Bt毒素蛋白。