护照于1999年办理，现已丢失并过期，需要向公安机关提交相关资料吗？

重新申请是可以的，但是一般申请新的护照，而你以前有老的护照，是要提供老的护照的。
楼主还是先申请一个证明，报挂失，然后拿这个证明代替老的护照。
但是，你这样的案例肯定不能当成是头一次的申请的案例。
费用都是200元。
楼主问问当地，如果他们管理不是特别的严格，你只要提供原来的护照的号码，应该也可以过。

99年办的早过期了，哪户口本去申请新的吧，出入境管理处，200多RMB,半个月左右。

签证时会考虑你的签证期限和护照有效期--- 6个月以上;
如你所说:
你可以到现在的户籍所在地的 '出入境管理处办理' 去办理，所需资料:身份证，户口本或者户籍证明，旧护照丢失证明等,一张打印好的2寸照片,和电子版照片(有的地方当场采集照片)即可，220元（加注20元),15天左右就能拿到了。