请问：一事业单位，拨出50万元给下属企业作企业注册资金，两单位如何记账！？

事业单位会计制度
财预字[1997]288号
会计科目 编号117 名称 对外投资
事业单位以货币资金对外投资，借记本科目，贷记“银行存款”科目；同时借记“事业基金——一般基金”科目，贷记“事业基金——投资基金”科目。

所以你的问题的正确答案应该是：

1、事业单位
借：对外投资500000
贷：银行存款500000
同时
借：事业基金-一般基金500000
贷：事业基金-投资基金500000

2、接受投资的单位
借：银行存款500000
贷：实收资本500000

呵呵，当然不对，事业单位的投资科目不是长期投资，而是对外投资
分录应该是
借：对外投资
贷：银行存款
下属企业
借：银行存款
贷：实收资本

1.借:长期投资50
贷:货币资金50
2.借:货币资金50
贷:实收资本50