小三阳会影响高校教师资格证的认证么？

不会。
考公务员会影响到。

教师资格证考试具体申报要求第四条规定：具有良好的身体素质和良好的心理素质，无传染性疾病（如乙肝、艾滋病、性病、肺结核、皮肤病），按《申请请指定教师资格证人员体检标准及办法》在教师资格证认定机构指定的县级以上医院体检合格，方能提出申请，申请通过才能进行面试和试讲。