运输发票在一般纳税人的企业中抵扣的是增值税还是所得税。

一、根据《中华人民共和国增值税暂行条例(08修订版)》的规定：
购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7％的扣除率计算的进项税额。进项税额计算公式：
进项税额＝运输费用金额×扣除率

二、根据《中华人民共和国企业所得税法》第八条规定：企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。

因此，1、运输发票中“运输费用”可以按照7%扣除率计算进项税额抵扣增值税。
2、运输发票中“运输费用”作为费用（当然是扣除“进项税额”后的余额）可以在计算应纳税所得额时允许扣除。

所得税没有抵扣一说，只有减免。运输发票中，只有7%的进项税部分在缴纳增值税时可以予以抵扣。具体规定如下：

1、对增值税一般纳税人外购货物（固定资产除外）所支付的运输费用，根据运费结算单据（普通发票）所列运费金额，依7%的扣除率计算进项税额准予扣除，但随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费不得计算扣除进项税额。

2、准予作为抵扣凭证的运费结算单据（普通发票），是指国营铁路、民用航空、公路和水上运输单位开具的货票，以及从事货物运输的非国有运输单位开具的套印全国统一发票监制章的货票。

3、准予计算进项税额抵扣的货物运费金额是指在运输单位开具的货票上注明的运费和建设基金。

4、纳税人取得运输发票，应当自开票之日起90日内，向主管国家税务局申报抵扣，逾期不得抵扣。

所以只要只要你是一般纳税人，且满足上述条件，就可以拿着运输发票到税务局认证（运输发票与增值税专用发票一样有密文区，需要认证），然后同增值税专用发票一样，会取得一张认证结果通知单，上面会列明可抵扣的进项税额，到时你就可以与增值税专用进项发票一样进行正常的帐务处理和纳税申报。计算进项税时，是用票面金额乘以7%税率，比如运费票面金额为10000元，那可抵扣的进项税则为700元。

增值税

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