我想把咒写成自己认识的字

可以啊,没什么不可以,或者你直接注解拼音也行,这样更方便，反正你也没想去搞懂里面的意思，再说了，本身咒很多都是梵文音译过来的!!

可以

只要自己能读懂能理解就行，又不是有意给别人看的！最初学习英语时，有很多同学使用汉字来标注英语读音（如：bed - 白的），也是这个道理。