你知道我是谁的英语？

you know who i am 正确。
这是一个宾语从句。know后面是一个从句，用陈述句语序。所以是前者。

you know who am i ？
特殊疑问句 对i提问

后者吧

应该是You know who am I.因为在这种类似特殊疑问句的句子中中要用陈述句语序～～

应该说：Do you know who I am ? who I am 是宾语从句 ，应该用正常的陈述语序
所以你列的两个句子都不对