沈醉为什么放者总务处长不当去当云南站的站长

这个不好说，可能他有自己的考虑吧。
总务处长官职虽大，但是在南京要受到好多比自己官职高的人的限制。
去云南站当站长虽说官职低一点，但是是一把手。而且他自己的性格比较适合云南站站长，不适合总务处处长。

当时的实际情况是毛的排挤 戴飞机失事后 唐\郑\毛曾经较量过一段时间
毛上台后 逐步培植自己的力量 沈是湖南人 就被下放到云南站了
沈应该对此很不满 在我这三十年等回忆中都有所埋怨

推荐楼主看沈醉的《我的特务生涯》，里面对楼主的疑问提供了详实的回答。
自从戴笠死后，军统内部唐纵、郑介民、毛人凤争夺领导权，后唐纵委任为警察总署署长，退出争夺，郑介民当选为改组后的保密局局长。后，沈醉因与毛人凤同为非黄埔出身，两人联手将郑介民搞下台，由毛人凤代之。之后，毛深恐沈醉取而代之，与醉之间便产生了芥蒂。某场合，毛对沈说，下面诸省站长资历太浅镇不住场子，需要资历老的大特务下派，沈也觉察到毛对其有所警惕，便试探说自己愿去，谁想毛随机答应并给出台湾和云南两种选择。沈后悔不已。
看其回忆录中可以得知，沈在南京准备离开期间充满了懊丧，认为自己在同毛的政治斗争中失败，而被迫“流放”。
而显然，沈醉同毛人凤关系相当不融洽。在云南即将解放期间，沈醉数次抵抗毛人凤的屠杀部分革命人士的命令，甚至当毛人凤从台湾到昆明监督期间，沈从当地购得毒药预谋杀之。后因其对当时国民党仍抱有幻想而放弃。

楼主不错