某企业以现金支付职工李某生活困难补助1000元这个事项的会计分录该怎样做？

给与员工的补助应当在“应付职工薪酬”科目进行核算，会计分录为：

借：应付职工薪酬 1000 贷：库存现金 1000
明细科目可设置“职工福利”、“李某”等。

应付职工薪酬账户：
　　1、账户性质：负债类账户，
　　2、账户用途：用来核算企业根据有关规定支付给职工的薪酬。企业按规定从净利润中提取的职工奖励及福利基金也在本科目核算。
　　3、账户结构：贷方记增加，登记本期应支付职工的各种薪酬；借方记减少，登记实际发放的各种薪酬。期末余额一般在贷方，表示尚未支付给职工的各种薪酬。
　　4、明细账户：应设置“工资”、“职工福利”、“社会保险金”、“住房公积金”、“工会经费”、“职工教育经费”等进行核算。

你的处理基本上是正确的，但是按新的会计准则的规定，你的处理就有偏差。

新的会计准则中的“应付职工薪酬”科目的归集以前的包括职工工资、资金、津贴和补贴、职工福利费、社会保险费、住房公积金、工会经费和职工教育经费等等一些内容。你可参阅：http://baike.baidu.com/view/581600.html?wtp=tt，即可明白。所以你应按书上进行处理。

你可以在“应付职工薪酬”科目下设，所需要的明细科目进行核算。

若是你单位执行的是小企业会计制度或者旧会计准则，按照你些的处理。
若执行的新企业会计准则则是要按照教材的的答案的。

新的会计准则中的“应付职工薪酬”科目的归集以前的包括职工工资、资金、津贴和补贴、职工福利费、社会保险费、住房公积金、工会经费和职工教育经费等等一些内容

应该是 借应付职工薪酬——职工福利费1000贷库存现金1000吧