企业缴税的时候，是要按税种的不同去不同的税务局缴纳吗？

是的。

国税局和地税局各有各的征管范围。

现在有个别地区的国税局为地税局代征城建税、教育费附加、所得税等，但是还没有全面推广。

现在税务局也在努力，未来你的愿望可能会实现。

国家将税款的征收机关分为国税、地税、海关等，是税法规定的，不是那个单位部门随意改变的，你说的那样当然好了，可是肯定做不到，至少现在。

是的，现在还不能在一个税务局把所有的税一次全部缴清。具体哪个税种在哪个税务局交要与你的税务主管部门联系，不完全一样。