怎样使用生物信息学来获取弃列?举例最好了。急!!!!

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/09/20 16:39:53
比如,获取M25113序列,blastp搜索swiss Prot库中的相似序列,方法是什么?

题主所提的问题涉及的是生物信息学基本数据库的操作。建议你可以阅读一下复旦大学钟扬教授编写的《简明生物信息学》,在这里我给予简单的介绍。

获取M25113序列

登陆NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),输入序列登录号(见附图),点击GO;点击Entrez的nucleotide数据库就可以找到你要查的序列。

blastp搜索swiss Prot库中的相似序列

目前swiss prot和trembl正在进行合并为uniprot,将来有可能不在存在单独的swissport和trembl数据库入口。你可以使用Uniprot(http://www.uniprot.org/)提供的blast服务来进行相似搜索。如果你一定要只对Swissprot进行搜索,我想最好的办法是下载swissprot数据进行本地blast分析。

可参考

http://zhidao.baidu.com/question/89071637.html

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