UC知道哪位帮忙翻译一下，谢谢了
来源：百度知道 编辑：UC知道 时间：2024/09/22 05:33:51
SWALIGN performs Smith-Waterman local alignment of two sequences.
SWALIGN(SEQ1,SEQ2) returns the score (in bits) for the optimal
alignment. Note: The scale factor used to calculate the score is
provided by the scoring matrix info (see below). If this is not
defined, then SWALIGN returns the raw score.
[SCORE, ALIGNMENT] = SWALIGN(SEQ1,SEQ2) returns a string showing an
optimal local alignment of amino acid sequences SEQ1 and SEQ2.
[SCORE, ALIGNMENT, STARTAT] = SWALIGN(SEQ1,SEQ2) returns a 2x1 vector
with the starting point indices indicating the starting point of the
alignment in the two sequences.
SWALIGN(...,'ALPHABET',A) specifies whether the sequences are
amino acids ('AA') or nucleotides ('NT'). The default is AA.
SWALIGN(...,'SCORINGMATRIX',matrix) specifies the scoring matrix to be
SWALIGN进行二个序列的史密斯船夫地方对准线。
SWALIGN (SEQ1， SEQ2)退回比分(在位)优选的
对准线。 注： 被用于的换算系数计算比分是
提供由计分的矩阵信息(如下所示)。 如果这不是
定义， SWALIGN然后退回未加工的比分。
[比分，对准线] = SWALIGN (SEQ1， SEQ2)退回串显示
氨基酸顺序SEQ1和SEQ2的优选的地方对准线。
[比分，对准线， STARTAT] = SWALIGN (SEQ1， SEQ2)退回2x1传染媒介
当起点索引表明起点
在二个序列的对准线。
SWALIGN (…， ‘字母表’， A)指定序列是否是
氨基酸(‘AA’)或核苷酸(‘NT’)。 缺省是AA。
SWALIGN (…， ‘SCORINGMATRIX’，矩阵)指定计分的矩阵是
使用为对准线。 缺省是AA或NUC44的BLOSUM50 NT的。
SWALIGN (…， ‘标度’，标度)表明计分的换算系数
退回比分的矩阵使用任意单位。 如果计分的矩阵
信息也提供一个换算系数，然后使用两个。
SWALIGN (…， ‘GAPOPEN’，惩罚)为打开空白指定惩罚
在对准线。 缺省空白开放惩罚是8。
SWALIGN (…， ‘EXTENDGAP’，惩罚)为延伸a指定惩罚
在对准线的空白。 如果EXTENDGAP没有指定，然后引伸
空白计分与价值和GAPOPEN一样。
SWALIGN (…， ‘SHOWSCORE’，真实)显示计分的空间和
赢取的道路。
例子：
%计算在位的比分并且退回地方对准线
使用缺省计分的矩阵(BLOSUM50的%。
[比分，排列] = swalign (‘VSPAGMASGYD’， ‘IPGKASYD’)
%用途用户指定的计分的矩阵和“空白开放”惩罚