为什么沪市股票从601以后，不是按顺序排的，有些号码没有？

并非你的软件问题，除了中小版股票是按顺序排列外，其余都是顺序错列。当年600开头的只有一部分按顺序排列的，后来就乱了。这个原因很复杂，有的公司代码以吉利取舍，如：中行的601988，发。有的用以体现其产品，如：三九医药，000999。

是有的，
因为这些在软件上没有列出来的是退市了
或是在三板中呢

有退市的，也有就是交易所预留的号码，为一些暂时没在A股上市的大公司.

有待考证