我在不知道情况下经营了劣质兽药，而农发局要对我进行处罚，所经营的公司却不负责

怎么就说是劣质兽药呢？正常程序是，如果抽检兽药不合格，可以申请复检，复检合格的话，不用出复检费用，如果仍不合格，申请人要负担复检费用，并且按照有关规定进行处罚。
但是，现在很多地方的兽药管理部门，基本就没有检测能力，只是找机会弄点钱花，作为一个兽药经营者，你要和他们处理好关系，争取私下处理，可以给他们当事人点好处，不要公对公的处理，因为你以后还要卖兽药的。
兽药公司能找到你，你也卖了他们的兽药，如果检测不合格按说是应该负担责任的，但是，此事你亲自去处理比较好，成本会低很多，如果公司出面，那帮人会狮子大开口的，建议你继续和业务员协商一下，争取用最少的成本解决问题。
中国的兽药管理啊，还得灵活掌握啊，不能认死理的。

个人先处理，公司承担部分费用，一贯做法。