大连有几个政府机关专用码头

没搞明白你说的啥意思

就政府机关而言，还真没听说过。

海事局，渔业局，好像有，但是海事局是辽宁的，在大连只是驻在。有的话就是在大连港那。渔业局的是在老虎滩，应该是老虎滩公园里，也就是107舰后边。
其它的不知道。