员工跟老板有关系而且经常仗势跟 我唱反调该怎样管理呢？

是不太好处理;

首先,就事论事,跟他讲事情最好跟领导先讨论或知会一下,省得被动

其次,对他要用公司的规定及领导的指令

最后,私下里要向他传达自己的难处(领导或公司交办的不得不做啊)

公正些，对你对别人都有好处

你和老板沟通时暗示一下该员工的行为，看看老板的反映，如果偏向你就好办了，如果老板不表态或者态度暧昧，你就比较棘手了，有可能老板就对你有意见，唆使他这样做的也不一定呢。