两部分工资怎么计税？

我们公司的员工的收入从两个公司支取。一部分从A公司，一部分从B公司。其中，A公司部分的工资超过现有缴税底线，需要缴纳个人所得税；从B公司支取的工资没有达到所得税缴纳标准。
我的问题是：
对B公司来说，还需要替这些员工扣除所得税吗？如果不扣，税务是否能够发现这些人从两个公司支取工资？

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