我公司是一般纳税人跨地区设立了一家非独立核算的分支机构，应怎样纳税

由你们总公司负责纳税。

分支机构不具有独立法人资格，没有独立纳税义务，他们只核算费用，不核算其他。

由总公司负责税款的缴纳。

跟公司一样交增值税或营业税及其它地方附加税。企业所得税按总公司所在地的税务机关核定分配给分公司的税额，在分公司当地预缴，年终由总公司汇总清算缴纳。

交在税务登记证的地址

既然是非独立核算的 那就是和总公司是同一套财务帐目 那就是总公司纳税就可以了