有关PCR引物

引物是自己设计的，当然要完全配对，干嘛要设计不配对的

基因的分解没有那么明显，是基因上下游中选出来两个片段做引物，基因没有明确的头和尾

实际上就是在基因的上游，和下游找了一段出来，完全和原来的配对。你找这个过程就叫设计引物
http://www.ebiotrade.com/newsf/2006-4/2006429175034.htm
这是引物设计的原则

不需要完全一样，但是仅仅在个别碱基上可以做修改，而且改过后扩增效率都不是很理想

想你所说的那种在两尾直接设计肯定不行！因为引物设计并不是简单的引物和产物匹配，你还需要考虑：
1.产物中还有与引物结合比较好的区域吗？如果有你的引物扩的带就不对了。
2.引物之间能相互匹配形成二聚体吗？
3.退货温度如何？
。。。。。。

设计引物需要考虑很多问题，比如上下游引物的退火温度不能相差太大；上下游引物之间最好不要有二聚体，发卡结构等产生，当然有时不能避免。这就需要对引物的碱基数进行修改，使各方面达到最佳。