中山大学医学院 浙江大学医学院 华中科技大学医学院 四川大学华西医学院 同济大学医学院 协和医科大学

协和最好，中山医次之，川大华科再次，然后是浙大，同济不怎么样。
再考虑到地域优势，优先选择的顺序应该是协和中大，再然后呢，川大华科应该说实力比浙大高出不少，但是浙大整体实力强，地理位置好，看你自己怎么选择了。
关于中山医的情况可以参见下面这个链接：
http://zhidao.baidu.com/question/114948524.html

楼上提到的07—09教育部学位中心的学科评估排名有参考价值，但并不是所有的学校都参与了，比如中山医的基础医学就没有参与此轮评估。请看下面这段说明：
一级学科代码及名称：1001 基础医学（2009年）
本一级学科在全国高校中具有“博士一级”授权的单位共25个，本次参评17个；具有“博士点”授权的单位共15个，本次参评2个；还有3个具有“硕士一级”授权和4个具有“硕士点”授权的单位也参加了本次评估。参评高校共26所。
那为什么有的学校不参加呢？是因为参加教育部的评估要准备很多材料，是一件劳师动众的事情，可以说对学校发展并没有多大好处。

四川大学华西医院，活体肝移植国内领先，
麻醉，影像都很好，
消化内、呼吸内，心胸外科是国家重点。

没同济大学医学院什么事……应该是华中科技大学同济医学院（原同济医科大学）。同济大学医学院好像是原来的什么上海铁路医专