建筑公司的帐应该怎么做？分别交什么税种？计税依据是什么？

你的问题涉及面太广了，我答一部份吧。
税种涉及：营业税及附加、个人所得税、企业所得税、印花税、资源税等，如果有相关其他产业，涉及的税种就更多了，但建筑企业平时遇到的税基本就是这些了。
计税基数：
营业税，基本是按照收取的工程款计算
个人所得税，分工资薪金，那个按税法计算。如果省级有其他规定再说/
企业所得税，小企业按率征收，一般企业按纳税项目征收
印花税，按收款金额计缴
资源税，建筑企业主要是代扣代缴的问题。

简单讲一下吧，这个讲起来太麻烦。建议看书。