is this Jim?的回答 is this Jim?的回答是Yes,it is.还是Yes,he is.

英语中不确定男女的时候可以用it(比如有人敲门),如果确定要用he或she,这题类似,所以用he.

应该是Yes,it is.
因为不确定Jim的性别，而且就算确定，看到文中的语境也可以判断出问者不知道这个人是否是Jim。
因为问句用了【this】，故判断出不是电话用语，所以这句话的语境是指认情况。在不确定对方是否是指人的那个人的情况下用it，婴儿也是，用it。

是Yes,he is.

Yes,he is.