我获得了第26届全国物理竞赛北京赛区预赛二等奖，是否有资格参加2010年自主招生?

怎么说呢……这个只能作为一项额外的条件了……
北京赛区的话，就要看北京地区的大学是否承认了，估计其他地方的高校应该不会承认这个。
无论如何，建议你去高校直接咨询一下。
一般来说，希望比较小。
但是，如果关系上有可联系的地方，应该也不是问题。