两条碱基数量相似的DNA电泳时采用什么方法可以将其分开

其实很简单，原理正如一楼所说。将DNA溶液分装成两组，每组DNA溶液加入只能作用于一条DNA链的特异性限制性内切酶，在酶切作用后，溶液中的一条DNA链被分解成为两条或多条DNA片段，而另外一条DNA的完整结构不变。这时再将两组溶液进行凝胶电泳，被切割的DNA片段会跑在凝胶的前端，而完整的DNA链即被分离出来。

还有一种相对麻烦的生化方法，这在生化实验中测定DNA和蛋白质的特异结合性经常用到，叫做band shift。如果你的两条DNA链中一条可以与一种蛋白质特异性结合（如一些 transcriptional factor），那么结合后的DNA就会变重，在电泳时因为质量变大所以条带拖后，即与另外一条没有结合蛋白质的DNA分离开来。或者在一条DNA与蛋白质结合以后，可以利用这种蛋白质的特殊性质，做亲和层析将蛋白质和与之结合的DNA分离出来，之后再通过使蛋白质变性变构等手段，使之脱离所结合的DNA，这样，两组不同的DNA即被分离出来。

方法还有很多，但剩下的可行性不大，或者步骤过于繁琐，就不一一列举了。分离的方法，主要还是取决于这两种DNA的特性，在没有这些条件的情况下，只能做如上猜想。

还有一个方法，就是做DGGE（变性梯度凝胶电泳），适用于分离条带大小一致或相近的dsDNA。使用的胶含有顺电泳方向浓度逐渐增加的变性剂，两个同样大小的DNA由于碱基组成不同导致的解链位置不同而分开，要回收这两条DNA只要割胶再PCR就可以了。

两条碱基数量差不多大小的双链DNA是不可能通过电泳将其分开的，因为电泳的原理就是根据DNA分子碱基对的长短不同而在电泳液中的迁移率不同实现将其分离的。
你重新看下题目是怎样描述的吧，若两条DNA的序列已知，则可以在寻找一个酶切位点，要求这个酶切位点在其中一个DNA中间位置，然后电泳.....电泳后再连接吗？晕了

呃呃。。。是个问题呃~~~~~~~~~~·

用不同的PRIMER呢？好像得到PCR那步哦？

看看，谁有好方法啊~~~~~~~~