我因驾驶摩托车，又交了罚款，C1驾驶证还是被扣12分，合理吗？

你如果没有E的准驾而在驾驶摩托车，那就是驾驶与准驾不符的违章：扣12分、罚200元以上00元以下。

罚款后再扣12分，警察没有错。

法律是这么规定的。
从来没有规定说罚了款就不扣分了。

被警察抓到的时候就应该承认无证驾驶，只要交罚款，不用扣分。
估计你自己耍小聪明，把驾照掏出来，企图蒙混过关，结果被扣12分。

合理。是按照你准驾不符来处罚的。交法明确规定的。你明明准驾证是C1，却驾驶其它车型。

如果你没有考E牌，罚款扣分算是幸运了，我们这边无证驾驶要拘留15天啊！
就算你有C1牌也只是代表能开小型汽车，开摩托就属于无证驾驶了。