我公司给对方公司开了一张增值税发票，但对方公司在90天后才发现发票内容错误，我

晚了，超期了，超过90天，出现任何问题你们的发票都不能红字冲销了，对方公司也有责任，90天之内干嘛去了？

不知道你的发票内容有误具体内容是什么，所以很难给你更具体的建议，双方协商解决吧，退票是不可能的了。

对方单位出具拒收证明，你在到税务局填发票红字冲回表，待审批后当月开红字发票冲回。

超过90天不能开红字发票了，只能追究责任，看你们怎么分担这笔增值税了。