能否凭保函支付预付运费

可以的，需要货主和A公司签订协议，而后本公司向A公司收取。
怎么有点像案例啊？说点实际的情况好了，A公司是货代，B公司是船公司。
一般呢，货代会和货主有协议的，特别是合作比较长久的情况！
货代方面呢可以在货主出具保函的情况下预付运费，但会扣压提单或核销单的！
货主其实占不到什么便宜的呢，顶多一点汇率差值而已！