老婆是农村户口，我是城镇户口；现在想办准生证，不知在男方女方哪边办理更好？是不是和将来的户口有关？

在双方任何一方户口所在地均可办理,你觉得哪里办方便就在哪里办好了.
和将来的户口没关系,如果想让他作为城镇户口就随你申报户口,如果想让他作为农村户口就随他母亲申报户口,与在哪里办准生证没任何关系.
你老波婆是农村户口,有机会生二胎,自己对照所在省的人口与计划生育条例相关条款.

其实都一样，关键看怎样考虑，不管在哪方办理准生证，孩子的户口既可以母亲，也可以随父亲，在城市生活的可能会好一点，但如果是在农村可能有再生一胎的机会，《北京市人口与计划生育条例》第三章第十七条第九款规定：在深山区长期居住并以农业生产为主要生活来源的农村居民，只有一个女孩，生活有实际困难的，经批准可以生育第二个子女。建议慎重考虑！（如果女方户口并非北京，那就另当别论，因为各省规定不同）

要看你们结婚证在哪里领的，就到当地的计划生育办公室领准生证。

可以根据具体情况，都可以的

是啊，小孩上农村户口在女方办，上城镇户口在男方办。

我个人提议还是办女方的 现在政府都在关注