长枝吸引

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/09/24 18:29:52
什么叫做长枝吸引现象,如何更好的避免此现象发生?
我想知道长枝吸引的具体概念,这个现象造成的后果我知道一点。

http://www.ymf.ynu.edu.cn/SCI/2007SCI/2007/%E9%BB%8E%E4%B8%80%E8%8B%87%EF%BC%882007%E9%81%97%E4%BC%A0%EF%BC%89.pdf
可以参考该文献

一般来讲,如果模型合适,ML的效果较好。对近缘序列,有人喜欢MP,因为用的假设最少。MP一般不用在远缘序列上,这时一般用NJ或ML。对相似度很低的序列,NJ往往出现Long-branch attraction(LBA,长枝吸引现象),有时严重干扰进化树的构建。贝叶斯的方法则太慢。对于各种方法构建分子进化树的准确性,一篇综述(Hall BG. Mol Biol Evol 2005, 22(3):792-802)认为贝叶斯的方法最好,其次是ML,然后是MP。其实如果序列的相似性较高,各种方法都会得到不错的结果,模型间的差别也不大。