报关件数搞错了，多报了三件，刚刚发现，货已经快要到客户那边了，怎么办啊？

你的出口和对方的进口没关系的。只要你提供给客户的箱单、发票数量正确就行，如果这个错了要赶快改。
你说货已经快到客户那边了，就说明在这边出口已经结关了，只要不影响收汇，问题不大。
如果非要说有什么后遗症的话，就是将来海关如果核查旧单子，有可能会查出来出口申报单证不符，但几率应该比较低，你不放心的话可以改单。