协议中写明乙方不再起诉甲方，这样日后乙方能反悔再起诉甲方吗

除非原协议签订有违法的地方，应该生效，不得反悔，反悔支付违约金，涉及人命，违约金3万不多。
超过两年没关系，应该是超过协议约定有效期两年后法律不支持。

(ˇˍˇ） 想起诉没问题，看你的理由、证据和需要解决的问题来定

起诉肯定可以起诉。

但法院在审理后，如认为该协议没有胁迫等情形，则不会支持他的请求。是否可以起诉和是否会胜诉是两回事，只要有事实、理由，有明确原被告，有诉讼请求，法院都会受理。