独立本科和本科的毕业证相同的吗?

相同。

本科段和独立本科段的区别和联系
①区别：本科段是本科专业的一部分，与其基础科段有直接的衔接关系。而独立本科段是在专科层次起点基础上又独立于专科层次的自学考试专业类型，这类专业与同专业的专科没有直接的衔接的关系。
②联系：两类专业都是专科起点专业，都可获得本科毕业证书。两者均有报考条件限制，即在申办本科毕业证时须交验国家承认学历的专科或专科以上毕业证书