微机出怪问题，周期性变慢

我的微机这两天突然出问题了，隔几十秒系统就会突然变慢2到3秒，
完cs或者其它游戏fps会突然到5左右，持续几秒恢复正常，然后周期性的出现。
我觉得不会是病毒或木马的问题。系统非常干净，没有一个可疑的文件。
分别用金山、nod32、卡巴5、卡巴6杀了一遍，没有任何问题。
防火墙用的天网，找不到任何可疑的活动程序。
任务管理器里可以看到cpu占用率虽然不高，但是也是周期性的变化，很有规律，和系统变慢的周期是基本一致的，主要是explorer和taskmgr交替产生的，但最高也就是20%，explorer本身也应该没问题吧，我是win2000sp4，这个文件大小237k。
服务也没什么可说的，基本都是ms的，而且都很老实，其他的基本都关掉了。
硬件有问题吗？
所有的驱动程序都换了一遍，没什么改变。
机箱也拆了好几次了，都正常。
不过机箱里有周期性的哨音，非常非常轻微，我一直怀疑是不是自己的错觉，这个周期和系统变慢的周期好像有点关系，但并不明显。因为声音很小，所以分辨不出是哪个硬件的声音。

总之现在急死了，偶也不是菜鸟了，但实在没见过这种问题，请高人指点，谢谢
配置：菜羊D310 主板：MSI-6791 (SIS648FX) 硬盘：ST 5400 2M 40G 内存：现代DDR400 256M 显卡：MSI 6600 双128（84.26WHQL)
用优化大师的磁盘检查发现有不明程序读写硬盘。
我有两个硬盘，从盘就没问题，请问是不是病毒程序在读写硬盘造成的速度变慢

有可能是硬件的故障了，机箱里的哨音虽然轻微可是很明显和cpu占用率的变化是一样的。

微机出怪问题，周期性变慢 电脑运行游戏时周期性的速度变慢，怎么回事 电脑变慢,怀疑是硬件出了问题! 微机问题 ADSL变慢问题~ 速度变慢问题```` 电脑变慢问题 网速变慢问题 笔记本变慢问题 机子变慢问题？